수원지검 특수부(부장검사 송경호)는 이인재 전 파주시장이 재임 시절 사업상 편의를 봐주는 대가로 지역의 한 업체로부터 뒷돈을 받은 정황을 포착, 자택 등에 대한 압수수색을 벌이는 한편 파주시 공무원 10여 명을 참고인으로 소환해 조사하고 있다.
 검찰은 특히 2004년 6월 서울 서빙고동 반포대교 북단에서 한강으로 투신자살한 이준원 전 파주시장의 자살 동기를 캐묻는 한편 대학설립 과정과 소각장, 재활용센터 운영 등 이인재 전 부시장의 재임 당시 인허가 업무에 대해 강도 높은 조사를 벌인 것으로 알려졌다.
 검찰은 또 공무원을 상대로 만두제조업체 대표 박 아무개 씨가 파주에 관광대학과 골프장 설립을 추진하면서 이준원 전 시장과 이인재 전 부시장에게 어떤 로비를 했는지 등 자살을 결심하게 된 배경을 조사했다.
 박 아무개 대표는 전남 보성 출신으로 이인재 전 시장과 동향이고, 현재 뇌물수수 혐의로 재판을 받고 있는 이재홍 시장에게 금품을 건넨 운수업체 김 아무개 대표가 박 씨에게 수억 원을 빌려줄 정도의 가까운 사이로 알려지고 있다.
 공무원 A씨는 “이준원 전 시장의 자살 동기가 뚜렷하지 않아 여러 억측이 있었던 것이 사실이다. 그래서인지 검찰이 당시 이인재 전 부시장과 관광대학 설립을 추진한 대표와의 관계를 집중적으로 물었다.”라고 말했다.
 검찰 관계자는 “수사 초기 단계라 뇌물을 준 것으로 보이는 업자와 액수 등에 대해서는 밝힐 수 없다.”라고 말했다.